В Устюрском государственном природном заповеднике насчитывается 795 видов беспозвоночных. Из краснокнижных бабочек в заповеднике встречается один вид – Microzergis pirothoe – Microzergis pirothoe.
В настоящее время зарегистрированные на территории заповедника представители наземных беспозвоночных относятся к 3 группам (насекомые, паукообразные, ракообразные), 11 отрядам, 84 родам и 795 видам.
